トップページつまり、ドキュメントルートのページのカスタマイズの方法です。

/app/views/pages/home.thtml
このファイルを用意します。

静的ページのみであれば、上記だけで良いのですが、プログラムも書きたい時にはコントローラーも用意します。

/cake/libs/controller/pages_controller.php
このファイルをコピーして、
/app/controller/pages_controller.php
ここに新規作成すればOKです。